| تکنولوژی |

بیوانفورماتیک و کرونا

بیوانفورماتیک و کرونا
شمیم غیابی
نویسنده شمیم غیابی

🧬مبحث: بیوتکنولوژی

📝مقاله قبلی: بیوانفورماتیک چیست؟

📝مقاله بعدی: بیوتکنولوژی و صنعت مواد غذایی

💻مدرسه تکمیلی: مدرسه مقدماتی و پیشرفته بیوتکنولوژی 

🖊شماره مقاله: 25

بیوانفورماتیک

بخش بیوانفورماتیک بخشی است که بر استفاده از ترکیبی از زیست شناسی و فناوری اطلاعات تمرکزدارد.در قلب صنعت بیوانفورماتیک داده‌های بیولوژیکی وجود دارد که با استفاده از تکنیک‌های خاص تجزیه و تحلیل و تبدیل می‌شوند.

بیوانفورماتیک همیشه در مورد پشتیبانی اساسی از بسیاری از زمینه های تحقیقاتی

علمی پتانسیل زیادی داشته است.ابزاری که بیوانفورماتیک می‌تواند فراهم کند به دانشمندان اجازه می‌دهد تا با مجموعه داده‌های بزرگتر کنار بیایند و آنها را استخراج و تجزیه و تحلیل کنند تا اطلاعات مهمی را که می‌تواند فراهم کند. . به دانشمندان  اجازه می‌دهد تا با مجموعه داده های بزرگتر کنار بیایند آنها را استخراج و تجزیه و تحلیل کنند تا اطلاعات مهمی را که، می‌تواند منجر به کشف شوند پیدا کنند.ژنتیک و ژنوم در سال‌های اخیر مورد توجه اصلی بیوانفورماتیک بوده است.از جمله ژنوم  مقایسه‌ای و ریزآرایه‌های ژن و ژنومیک عملکردی است. افزایش آمار تقاضا  برای اسید نوکلئیک وتعیین توالی پروتئین و همچنین داده‎‌های یکپارچه و رشد بازار بیوانفورماتیک را تاکنون هدایت کرده است.

  یکی از مهمترین زمینه های تمرکز برای هر کشور، دستیابی به ساختار اصلی کرونا ویروس است.با هدف یافتن راهی برای جلوگیری از پیشرفت آن است. رمزگشایی از ژنوم کرونا ویروس  که مسئول بیماری‌ است، برای تولید واکسن و درک بهتر نحوه عملکرد و دلیل تأثیر آن بر روی انسان بسیار مهم است. در حال حاضر مطالعات مختلفی انجام شده که پایه اصلی آن  توسط بیوانفورماتیک انجام شده یا تجزیه و تحلیل پیچیده توالی ژنوم ویروس   تحلیل است به منظور آزمایش  شناسایی اینکه کدام گونه ها می توانند برای آزمایش واکسن ها مناسب باشند. بیوانفورماتیک نقشی اساسی در ایجاد توانایی در محققان برای ایجاد بسترهای تجسمی که فرصتی برای درک بهتر ویروس در حال حاضر وجود دارد ، داشته است. این تحقیق همچنین برای تکامل و شروع جهش برای آینده بسیار مهم خواهد بود. بیوانفورماتیک یک موضوع جذاب است و از اهمیت ویژه ای در وضعیت فعلی برخوردار است .    

اولین پیشرفت بیوانفورماتیک در این همه گیری شناسایی جزئیات توالی زیستی جدید کروناویروس بود. 

 در ویروس کرونا و ساختار کریستالی آنزیم پروتئاز آن در حال حاضر توسط تیمی از دانشگاه‌ها و موسسات تحقیقاتی سراسر دنیا توالی یابی و روشن شده است

  متصل شده است.  N3 ساختار پروتئاز به‌ مهارکننده

توالی یابی نقطه ای شروعی در توسعه داروها، ابزارهای تشخیصی و واکسن برای ویروس کرونا بود.تلاش برای یافتن ژن هایی که مسئول تکثیر ویروسی هستند و پروتئین مسئول اتصال سلول میزبان به ویروس از این توالی بهره‌مند شده است.

براساس آن اطلاعات اولیه، دانشمندان با ابزارهای تشخیصی واکنش زنجیره‌ای پلیمراز رونویسی معکوس را توسعه داده‌اند که توسط سازمان بهداشت جهانی تأیید شده است .که در این مقاله می توانید نتیجه تحقیقات را مشاهده کنید.

بیوانفورماتیک نقش اساسی در ایجاد توانایی در محققان برای ایجاد بسترهای تجسمی که فرصتی برای درک بهتر ویروس در حال حاضر وجود دارد داشته است. این تحقیق همچنین برای تکامل و شروع جهش کرونا ویروس برای آینده بسیار مهم خواهد بود.

  با ابزارهایی طراحی شده‌اند که بر اساس روش همترازی   PCR   پروتکل‌های توالی بیوانفورماتیک بودند. این نشان می‌دهد که بیوانفورماتیک در تلاش‌های   اولیه برای توسعه پروتکل آزمایشگاه برای تشخیص ویروس کرونا نقش داشته است.

توسعه داروها و به خصوص واکسن ها یک بازی متفاوت خواهد بود.این کار را می توان با اصلاح ساختار شیمیایی داروهای موجود کروناویروس با ابزارهای شیمی محاسباتی انجام داد. مرحله بعدی انجام شبیه سازی های عظیم مولکولی با استفاده از ابر کامپیوترها برای به دست آوردن بهترین ترکیبات  دارویی به عنوان نامزدهای موادموثره با کارایی بالا در م.اجهه با ویروس کرونا دانست. ابر کامپیوترهای مدرن می توانند پیچیدگی واکنش بیوشیمیایی در سلول را شبیه سازی کنند، بنابراین شباهت آشکاری به محیط آزمایشگاه خواهند داشت.  

     استفاده از فناوری اطلاعات برای سازماندهی و استفاده از اطلاعات بیولوژیکی در زمینه هایی مانند زیست شناسی تکاملی، بیوانفورماتیک یک زمینه همیشه در حال رشد از تحقیقات است.ما می خواستیم نگاهی به چگونگی بیوانفورماتیک و نحوه مقابله آن با ویروس کرونا بندازیم.

استفاده از بیونفورماتیک برای جستجوی درمان ها

وقتی صحبت از تسریع در مبارزه با کروناویروس می شود، بیوانفورماتیک ابزاری ضروری برای مراکز تحقیقاتی است که آزمایشگاه های تحقیقاتی دارند. ما در حال حاضر شاهد استفاده از بیوانفورماتیک برای تحقیق در مورد ویروس و درمان های احتمالی آن، تجزیه و تحلیل ژنوم کروناویروس و جهش های متوالی آن هستیم، و همچنین از آن برای جستجوی داروها و درمان های ایمنی مانند آنتی بادی ها و واکسن ها استفاده می کنیم.

ژنومیک چه نقشی دارد؟

مطالعه ویروس کرونا و درک چگونگی تکامل آن از طریق اپیدمی های مختلف مانند

   در سال 2012 ضروری است. MERS در سال 2003 و SARS

چرا که این امر ما را قادر می سازد تا ببینیم ویروس چگونه می تواند بین گونه ها  پخش شود، و بفهمیم که چه تغییراتی باید انجام شود تا این انتقال ممکن شود.   به تازگی منتشر شده است می توانید دقیق تر شناساییPubMed  در این مقاله که در   ژن‌های کووید توسط بیوانفورماتیک را بررسی کنید.

مکانیسم های مورد استفاده برای تعامل با هر دو سیستم ایمنی بدن ما و گونه های دیگر این ویروس در تقابل با سیستم ایمنی بسیار اهمیت دارد. بیوانفورماتیک در جستجو برای درمان و به طور مشابه، پیشگیری و پیش بینی شیوع ویروس در آینده است.

کد ژنومیک اساسا می گذارد از طرح ویروس و ویژگی های آن پرده برداریم. در حال حاضر مقدار زیادی از توالی ویروس وجود دارد, و قادر به ارزیابی فاصله تکاملی بین این نقاط داده ها و تجسم ویروس کمک می کند تا محققان برای کسب اطلاعات بیشتر در مورد سویه های مختلف ویروس, از  تکنیک‌های بیوانفورماتیک استفاده  کنند. 

بیوانفورماتیک در جستجوی درمان هابا یک فرایند تحقیقاتی معروف به نام:

ˮDockingˮ

سعی در یافتن راهی بهتر برای درمان سریعتر و موثرتر برای ویروس کرونا است.

پاندمی چه تاثیری بر بازار‌های بیوانفورماتیک گذاشته است؟

بازار بیو انفورماتیک برای مدتی مکانی پرجنب و جوش بوده است بطوری که حتی در سال 2017 در سطح جهانی 6389 میلیون دلار درآمد کسب کرده است.

پیش‌بینی‌های انجام شده برای دهه‌‌های آینده از سال 2018 تا سال 2025 رشدی بالغ بر 13.8% خواهد داشت. ولی این پیش‌بینی برای قبل از پاندمی ویروس کرونا بوده است.

مجموعه پادکست بیوانفورماتیک و کرونا

به شما پیشنهاد می‌کنم موضوع جذاب بیوانفورماتیک و کرونا را به مطالعه‌ی این مقاله محدود نکنید و حتما مجموعه‌ی پادکست زیر را برای بررسی دقیق‌تر این موضوع بشنوید!

مجموعه پادکست بیوانفورماتیک و COVID-19
اپیزود اول
اپیزود دوم
اپیزود سوم
اپیزود چهارم
اپیزود پنجم
اپیزود ششم
اپیزود هفتم
اپیزود هشتم

با توجه به پیشرفت این علم و تاثیرگذاری آن بر افزایش سرعت کشف راحل‌های کاربردی برای پایان دادن هرچه سریع‌تر به این پاندمی اهمیت شناخت و یادگیری این علم برای پیروزی بر پاندمی‌های آینده مشخص می‌کند اگر علاقه‌مند به  شناخت بیشتر این علم هستید پیشنهاد می‌کنم این مقاله درباره‌ی مقدمات بیوانفورماتیک را مطالعه کنید.

درباره نویسنده

شمیم غیابی

شمیم غیابی

من شمیم هستم ۲۱ سالمه و دانشجوی داروسازی عاشق کتاب و فلسفه ام و کشف کردن آدما و شخصیتشون از بخش های مورد علاقه ی منه معمولا آدم کم حرفیم و درونگرا ولی شنونده ی خوبیم عاشق هدف گذاری و تلاش برای رسیدن بهشون هستم ودر آخر یکی از شعرهایی که خیلی دوسش دارم: ((تیرگی خاک در بلندترین شب ها از همت زلال تو روشنی می گیرد ))

1 نظر

  • سارا شاه حسینی سارا شاه حسینی می گوید:

    با سلام و احترام .ممنون از سرکار خانم شمیم غیابی بابت اطلاعات مفید و کاربردی که در این صفحه گذاشتید .با آرزوی توفیق روزافزون برای شما

ارسال نظر